Ruim een jaar geleden had detective Lindsay Boxer het leven waar ze altijd van droomde, met een prachtig kindje en een geweldige man. Ook met haar carrière ging het goed: samen met haar man Joe wist ze de misdadiger op te pakken die met een bom vijfentwintig mensen ombracht. Maar Joe bleek geheimen voor haar te hebben en ze durft hem nog steeds niet volledig te vertrouwen.
Terwijl de rechtszaak tegen de bommenlegger begint, worden de inwoners van San Francisco getroffen door onverklaarbare hartaanvallen. Linsday Boxer moet zichzelf een haar man in de rechtszaak verdedigen en een dodelijke samenzwering voorkomen, voordat zij zelf wordt veroordeeld.