De grootse deeltjesversneller ooit gebouwd, diep in een berg in Navajo-gebied in Arizona, moet de Amerikaanse regering inzicht geven in het geheim van het ontstaan van alle leven: de Big Bang. Het begin van alles.
Het is echter al een tijdje stil bij de wetenschappers die de versneller - die ze liefhebbend Isabella noemen - aansturen. Wyman Ford, ex-CIA, wordt teruggeroepen in actieve dienst om te infiltreren en uit te vinden welk geheim de wetenschappers, onder leiding van de charismatische Dr. Hazelius, verbergen.
Tegelijk lopen de politieke spanningen rondom het Isabella-project op: de Navajo-natie protesteert tegen de ontheiliging van haar land en de rechts-christelijke lobby brengt zwaar mediageschut in stelling omdat de Big Bang in strijd is met de scheppingsleer.
Als Ford er dan achterkomt wat er gebeurt als Isabella op vol vermogen werkt, begrijpt hij waarom de wetenschappers koste wat kost dit geheim voor de wereld verborgen moeten houden...