Een archeoloog en goede schoolvriend van forensisch patholoog Jack Stapleton heeft zojuist een belangrijke ontdekking gedaan. Hij heeft de botten van de maagd Maria en het evangelie van Simon gevonden, een vondst die de katholieke kerk op haar grondvesten zal doen schudden.
Een andere schoolvriend van Jack, de aartsbisschop van New York, kan dit niet laten gebeuren. In deze strijd van geloof versus wetenschap komt Jack tussen beiden in te staan terwijl hij tegelijkertijd op zijn eigen vakgebied een persoonlijke kruistocht tegen alternatieve geneeswijzen voert.
Tot overmaat van ramp komen hij en zijn vrouw Laurie erachter dat hun vier maanden oude baby kanker heeft. Nog niet eerder is Jack zo heen en weer geslingerd tussen hoop, geloof, wetenschap en vertrouwen.