Door mysterieuze omstandigheden komt de jonge, succesvolle Amerikaanse sopraan Pamela Morton tijdens de repetities van Mozarts Die Zauberflöte in het Wenen van de 18e eeuw terecht. Tijdens de repetities verliest zij door onverklaarbare omstandigheden het bewustzijn en ze komt weer bij in het jaar 1791 in het lichaam van hoedenmaakster Luise Heuler. Dan wil het toeval dat ze Mozart zelf tegenkomt, samen met de theaterdirecteur Emanuel Schikaneder. Vanaf het eerste moment voelen Luise en Mozart zich tot elkaar aangetrokken. Luise komt op het spoor van een samenzwering van Vrijmetselaars rond Mozarts meesterwerk Die Zauberflöte. Twee rivaliserende geheime loges bestrijden elkaar op leven en dood. Steeds verder dringt zij tot de geheimen van dit Vrijmetselaarsconflict door, waar ook Mozart zelf deel van uitmaakt. Dan blijkt dat de opera zelf de sleutel tot het conflict is en dat de symboliek van de compositie een magische werking heeft in de strijd tussen goed en kwaad.