Sluikwaar begint in de Leidse academische wereld en voert de lezer via Rome en Jeruzalem mee naar het negentiende-eeuwse Italië, waar de oplossing van het Cronesteijn-mysterie te vinden is. Ook een andere kwestie wordt opgerakeld: waarom overleed de eerste directeur van het Rijksmuseum van Oudheden zo plotseling?