Zoon van Berlijn is het verhaal van een Berlijnse familie, waarvan de zoon werd geboren op de dag dat de Muur viel. De vader, Jakob, ziet dat moment nog altijd als de vonk die in hem het engagement deed ontvlammen, maar zijn politieke idealen zijn sindsdien ondergesneeuwd door het pragmatisme van de realiteit. Zoon Fabian dwaalt doelloos door het leven, maar wordt wakker geschud door een wonderschone activiste, die de stad probeert te behoeden voor een totale uitverkoop. Intussen kondigt de vrouw die het gezin sinds de mentale ineenstorting van de moeder bij elkaar houdt, haar vertrek aan.