De oorlog van mijn moeder is het ongelooflijke, waargebeurde verhaal van het jonge meisje Inge. Tijdens de Tweede Wereldoorlog raakt zij, samen met haar Indische moeder en broer, op drift in Nederland. Inges vader, een bekend marineofficier, is dan al afgevoerd als krijgsgevangene naar de Oekraïne. Het gezin weet niet of hij nog leeft. Ongewild belandden Inge en haar moeder en broer steeds op het verkeerde moment op de verkeerde plek: in Vlissingen raken ze alles kwijt bij een evacuatie; in Den Haag belanden ze in Sperrgebiet; in Arnhem komen ze in de Slag om Arnhem terecht; in Amstelveen brengen ze de hongerwinter door in een huis vol vluchtelingen waar ze op een haar na ontsnappen aan het bombardement op de Keyser Karel Kade.
Na de oorlog staat Inges vader plots op de stoep. Maar rust wordt het gezin niet gegund. Al snel vertrekt het naar Nederlands Indië, waar vader het commando over een marineschip krijgt waarmee hij de binnenwateren van ‘opstandelingen’ moet ‘zuiveren’. Voor Inge is Indië een groot, soms ook angstig avontuur, voor haar moeder is het een verschrikkelijke desillusie; Indië lijkt, na Jappenkamp en Bersiap, in niets meer op haar geboorteland. Als Nederland de onafhankelijkheidsverklaring tekent, neemt Inges vader een beslissing die zijn leven, en dat van zijn gezin, dramatisch zal veranderen...